甜椒果實之貯藏能力，將影響市場運輸及架售生命。一般栽培中品質好壞會直接影響其貯藏能力。
(一)貯藏中的變化：
　　一般採收時其葉綠素、胡蘿蔔素及其他色素含量或維他命C含量均極高，但隨著貯藏時間之 增加含量逐漸降低，同時也失去光澤。另外長時間之貯藏，亦可能發生一些病害，如白涓病、菌核病、疫病、灰黴病，等貯藏性病害，而造成腐爛。而這些病害主要是在田間已感染。
(二)貯藏的條件：
       溫度：甜椒於10℃之環境貯藏時，病害發生較遲，低於10℃以下溫度貯藏時，容易發生貯藏性病害，而造成腐爛。同時低溫易容易造成生理障礙使種子褐化。但10℃貯藏時生理變化，較低溫下變化快，降低其成份。一般採果時，應以利剪於留1.5 cm長果梗處剪下，傷口應使乾燥避免病原侵入。

       氣體條件：採收後以密封之塑膠袋包裝貯藏可減少水份喪失，同時因二氧化碳之累積而降低其呼吸率，延長貯藏壽命，但腐爛率高。因此如何適當打孔維持低呼吸率及新鮮度，有待多方考慮。

       貯藏之內在條件：一般採收後宜迅速冷卻，降低田間熱，使呼吸率降低較有利於貯藏。

(原文來源:https://kmweb.coa.gov.tw/knowledge_view.php?id=1623)